李秀成离开金田村的当晚，庆贺完天王洪秀全生日的寿宴流水席一结束：“太平天国”经高层集体讨论通过，由冯云山执笔，以天王洪秀全的名义张贴颁布了五条军令：
第一，格遵条命。
第二，别男行女行。
第三，秋毫莫犯。
第四，公心和摊，各遵头目约束。
第五，同心合力，不得临阵退缩。
五条军令中第一条强调的是服从命令听指挥，实质是树立洪天王及五军主将的绝对权威，第二条最为古怪，就是全军上下按性别分别建立了男营和女营，大美女洪宣娇所创立的女六营编成最早的女营，由洪宣娇及杨秀清的妹妹杨云娇担任正副师帅，男营女营间相对独立互不往來，更奇怪的是原來的夫妻也须别营，也就是分别加入男女营，日常战斗生活随各营展开，夫妻间再不准约会**，甚至有时都难得见上一面……也就是这一条古怪反人性的规定，日后深受那些咒骂“太平天国”为邪教组织的人士所诟病。
第三条秋毫莫犯讲的是对民纪律与政策：“太平天国”早期之所以像吹气球般地飞速扩张壮大，这第三条起到了至关重要的决定性作用，从來大灾大乱之年兵匪一家，不扰民的军队老百姓几乎从未听说过，等亲眼看到“太平天国”的军队军纪严明，对百姓确实秋毫不犯，拥护及要求从军的人立时成倍增长。
第四条也就是后來天国“圣库制度”的雏型，取消私有制，不分兵将，所有人的私人财富物品一律交予公库，取用时按军制实行集体统一分配，大家同吃同住官兵一律平等。
最后一条是倡导打仗时的勇敢精神，崇尚协力力不提倡逞个人英雄主义。
随军纪同时公布执行的还有“天国”的军制，冯云山带几个读书人翻阅典籍，依照《周礼》中的“五人为伍，五伍为两，四两为卒，五卒为旅，五旅为师，五师为军”的记述，为洪秀全自创了“天军”十分独特而古怪的军制，，即一名伍长管四名战士，两司马领五个伍长；一卒长统领四个司马，而每位旅帅管辖五名卒长；再上溯一位师帅节制五个旅帅，而一位军帅统驭五名师帅……像浔江女侠苏三娘，就被任命为军帅，师帅以上的女将不受“女营”制度约束，亦可指挥男兵打仗：“军帅”一职看似名头不小，却还只是基本战斗单位的军事首长，军帅以上的军阶等级更加繁芜，分设将军、总制、监军sān_jí，sān_jí之上为检点，检点之内再分殿左殿右36名“检点”；检点以上是丞相，细分为天、地、春、夏、秋、冬共六种24人，而丞相上面才是洪天王借“天意”任命的前后左右中五位主将，主将又以中军主将杨秀清为尊……
洪秀全于军令军制颁布当晚特地亲自去探望后军主将冯云山，一來想对军中条文的拟定道谢，二來对最终冯云山地位排序屈居第四而表示安慰，洪秀全进门时，冯云山正秉烛伏案奋笔疾书，后者见洪天王造访便要下跪，被洪秀全托住他说：“云山呐，私底下你我是朋友兄弟，不必拘此礼数；众人面前讲究程仪就够累人的了，咱二人叙旧可像过去那样随便一些！”为了表达亲近天王故意翻看桌上的书籍纸张，问道：“云山在写什么？”
冯云山答道：“我在编撰咱们太平天国的历法！”
“好哇好哇！”天王首肯道：“今天公布的那些军规军制、未來天朝的典章制度，当然还有你手上这套天国历法，都是咱们太平天国的立国之本，要多仰仗你冯大秀才的学识与生花妙笔呀！”
“不敢不敢，云山当尽心而为！”冯云山谦逊说。
洪秀全见他又伏首去书写，登时心有所感道：“云山呐，你是跟随我一起创立拜上帝会的，七年前，，是七年前吧！你冯云山抛家舍业，千里迢迢來紫荆山区传教，连杨秀清、萧朝贵都是经你手发现**出來的，可今天代上意宣布排位，这两人却不得不位列在你的前边，朕的心里很难受很不是味道！”
冯云山抬头道：“这也沒什么？杨秀清、萧朝贵都拥有一方教众，人望很高，对天国兴盛举足轻重，为天国大业着想，云山甘居其次绝无半句怨言！”
一席话讲得洪秀全心中潮热，越发觉得对这位老友充满了疚愧。
洪秀全深知：无论是拜上帝会还是今天成立的太平天国，这冯云山都居功至伟，立下了汗马功劳，记得道光二十四年他与冯云山南历广州、顺德及南海等地传教，处处被人嘲笑作弄，广东人并不买他这位“君王全”的面子，洪秀全几乎心灰意冷想罢手了，是冯云山替他打气鼓劲，规劝他雄心不可灭，机会总会到來，并具体分析形势，认定广西百姓日子过得穷苦：“來土之争”愈演愈烈，改去广西传教易于奏效，二人这才经封川进入广西的深山密林……
为了传教，遇到吃喝不济身无分文时，冯云山在南山口古林社拾过牛粪，还帮人打过短工，为地主韦昌辉家放过牛，两年多苦日子熬下來，终于发展起第一批信徒，有了少数知音，这才在黄泥口一户人家落下脚当了私塾先生。
七年來洪秀全忙着往返于广东广西，并未曾全身心地投入到广西紫荆山区传教，他曾多次回到花县老家一边教书一边撰写理论文字，而冯云山这七年却始终如一，风风雨雨、抛妻弃女坚持在大山里，把他自己从一位文弱书生硬变作了地道的山民及烘炭佬，许多拜上帝会