船舶在接近海峡向信号台报告时，信号台会临时通知引水上船的时间和地点，船方一定要核对好上船位置并做好各项准备，安全接近登船点。如果船舶是从智利港口开出东行经过麦哲伦海峡，引水一般在西海岸（43°35′s//074°00′w）附近上船，引水上船后经沿岸航线驶抵麦哲伦海峡，中途不更换引水。
从东部进入海峡，如果天气良好，引水员会按预定时间在海图标绘的引水站登船。如果提前到达。引水将用vh16呼叫船减速接近引水站，如果风浪较大，引水会要求在第一狭水道入口处登船。船舶如果只申请强制段引水，引水上下船都是由引水艇接送。如果是申请的全程引水。船舶也可申请直升机接送，但船方必须符合直升机接送条件。如引水在太平洋入口上船，引水艇费用比引水费用本身还要高出一倍，而直升机接送引水的费用只有小艇接送费用的一半，因此具备条件的船舶申请全程引水时可申请直升机接送。
另外，据引水员介绍。大型船舶基本都申请全程引航，小型船自引较多，有些自引的西行船舶为了白天通过第三狭水道（paaarenas港等待锚地抛锚。海峡两侧基本由连绵的山脉和岛屿组成，72°w以西至太平洋入口除了覆盖少数植被外，以秃山、岩石为主，除导航灯塔外无背景亮光。在海峡中部arenas港附近航段岸形易辨，背景亮光较多。东部入口处的100海里范围内则以矮山为主，少树，多以植被覆盖。贯穿整个海峡，海拔较高的山脉顶部常年积雪覆盖，海拔较低处仅在冬季覆盖积雪。
麦哲伦海峡自大西洋入口，即正横puntadungener灯塔全长320海里。其
中位于海峡东侧的强制引航区域约90海里；非强制引航区域位于海峡西侧约230海里。
海峡内有3处狭窄地段，分别称第一狭水道（priura），位于海峡东入口处，中心位置（52°30′undaangoura），中心位置（52°43′s//070°20′oso），中心位置（53°33′s//072°25′w）。第一和第二狭水道在强制引航段内，第三狭水道在自引航段内，在三个狭水道内的部分航段可航宽度小于1海里，其他航段的可航宽度都大于1海里，对于大型船舶避让也没有问题。
整个海峡的主航道自东至西可以分为四个部分。(~^~)