马云还是亲自去了一趟工部，工部的主事和郎中们，七手八脚地打开戊字库，花费一天的时间进行清点，发现的确在总数目上，不太能对上。比如弓箭弦条就少了二三十条，盔甲也少了十几具，最后就是火铳，少了十几把。
工部的官员比较尴尬和局促，在马云问起来的时候，就解释道：“盗库，以前也有过，不过黄部堂来了以后，管得严格，亲手办了一起监守自盗的案子，从此之后，戊字库几乎没有再盗泄了。”
马云“嗯”了一声，道：“没有了？那这些东西怎么对不上数额？”
“公公可曾听闻一个词，叫‘火耗’？”工部的人解释道：“这个词儿是宝源局常常挂在嘴边的，说碎银熔化重铸为银锭时，会有所折耗，不是原来的重量，铜也一样。给了多少原料，炼出来也不是算好的这个数目，总会有所损耗，所以数目对不上，是正常的。少了一十、二十，便都在损耗之内，这在账目上，也是写得清楚的，请公公查验。”
马云还没有开口，倒是一旁的庄敬呵呵冷笑道：“我怎么觉得，这是以铜耗为借口，而掩盖盗库的真相呢？”
工部的人闻言全都怒目而视，马云觉得很有意思，因为他看出来了，这些工部的人，似乎对锦衣卫感观很差，而且这两方以前明显是有过接触的。
事实上，的确是有的，工部尚书黄福营建北京宫殿，和纪纲有了许多矛盾，因为从深山采出来的木头，没有如数送到北京去，因为纪纲私自截留了，修他的宅邸。
黄福知道纪纲是皇帝面前的红人，忍了一两次，但是没想到纪纲变本加厉，危言横索，继续截留木材，让黄福忍无可忍了，上书弹劾了纪纲道“传造采办器物及修建坛庙乐器，多自加徵，糜费巨万。工厂存留大木，斩截任意。臣福力不能争，乞早赐罢。”
皇上因此斥责了纪纲，纪纲当然有原因可以蒙混过去，但是因此就忌恨了黄福并工部的一应人等，之前还有一些个案子，专门牵连了根本无罪的几个工部郎中，所以工部的人，都深为厌恶锦衣卫。
马云似乎感觉他像是被牵着鼻子走了——似乎案子总是按照纪纲的心意来，他和谁有仇怨，而那个人就能很巧妙地牵涉在案子里，他冷眼看着洋洋得意揪住不放的庄敬和李春，忽然道：“纪大人还在审讯张升吗？”
得到了肯定的答案，马云就道：“纪大人对这案子如此上心，真是尽忠职守，相比之下，我这个人就怠慢许多了，几天过去了，什么成果都无，怕是皇上知道了，又要骂我老糊涂虫了。”
庄敬李春几个就宽慰起来，然而马云却道：“总要有些作为才是，我看纪大人一直关着工匠不曾审讯，想来因为人数众多，不好下手，那就让我来问一问罢，给纪大人减轻负担。”
李春顿时一怔，几个人打了个眼色，然而马云的速度很快，军器局的一众工匠很快被聚集在院落之中，惶惶不安两股战战，然而也不乏眼神交汇、神色玩味之人。
这些人已经知道了锦衣卫查办的案子是什么了，如果火器数目交接不上也就罢了，偏偏还有“通倭”的罪名，顿时磕头如捣蒜，哀声求饶道：“冤枉啊！我们冤枉！跟我们没有一点关系啊……”
马云就道：“我相信你们绝大多数都是无辜的，但是也混着有罪之人。有罪之人我不敢开脱，也开脱不了，你们早些承认，就不会牵连其他人，总要有人付出最惨重的代价，你们总也知道锦衣卫的手段，若是没有人承认，那大家就一并倒霉——想想看，不值得啊！”
说到锦衣卫的手段，果然不少人的心里防线都崩溃了，然而马云眯起眼睛仔细看了一圈，发现大多数的工匠都比较镇静，并没有特别惧怕的神色，而夫役之中，老一点的似乎也不怕，而年轻的夫役却瑟瑟发抖，非常恐惧。不一会儿，一个二十多岁的夫役突然站起来，指着身前一个四十多岁的工匠道：“他、他私造火器！他干的事情，跟我们没关系！”
“住口！”被指认的工匠怒不可遏，跳起来破口大骂道：“你要害死我们！”
然而这人很快就被拖了出来，马云一挥手，想叫人带下去审问，然而立在一旁的锦衣卫纹丝不动，马云挑了挑眉，转头看向身后的袁江和李春，后者慢吞吞走来，道：“公公，这军器局不是审讯的地方，下官提议将人带去诏狱之中，公公意下如何？”
马云一看这地方果然像个冶炼厂，不适合问讯，就同意将这名名叫赵祥的工匠并他手下的五名夫役，包括刚才那个指认他的人，一并带去了锦衣卫诏狱之中。
然而马云很快被纪纲请过去，说他的审讯有了一些结果。
“张升和神机营谭广私相售卖火铳，”纪纲把张升的口供拿出来给他看：“市舶司官员玩忽职守，贪污受贿，这都是证据确凿的。”
市舶司的职责是根据舶商的申请，发给出海贸易的证明(公验﹑公凭)，对准许出海的船舶进行检查，察看有无挟带金银、铜钱、军器、马匹、人口等违禁之物；船舶回港途中，要派人前去封堵(封存货物)，然后押送回港。抵岸后，差官将全部货物监搬入库，并对全体船员进行搜检，以防私自夹带舶货。同时将舶货抽分，细色(珍贵品)十取一，粗色(一般商品)十五取一。同时征收舶税﹐三十取一。
然而马云看过了这些供词之后，慢条斯理道：“纪