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隔日早朝，御史中丞联合多名文官弹劾吴王私造兵器库一事，凌朔认为兵器库规模太小，不足以立案，不以为意地驳回御史中丞的奏折。午朝时又接到河清提刑按察使司上奏，言吴王与西凉王室暗中有密信来往，似有反叛之心，十分可疑。凌朔当即大怒，特令大理寺少卿与西南巡抚去河清彻查此案，若河清提刑按察使司所言属实，则将吴王羁押回京，听候处置。
二月十三日，凌朔派去的人果然在吴王府中搜出其与西凉王室来往的密信，且在吴王府的地下仓库中又发现一个规模更大的兵器库，其中锻造兵器所用的材料皆为西凉特有的“黑铁”。消息传到京师，举朝皆惊。凌朔震怒，下旨即刻捉拿吴王。二月十四日凌晨，吴王携家眷潜逃，在河西境内被西南巡抚带兵截住，吴王自刎未遂，同家眷一起被西南巡抚扣押回京，。
二月十八日。吴王谋逆案又牵扯出许多大大小小的官员，临近河清的河西、太和等州皆有官员卷入此案，就连京师的官员也不在少数。凌朔愤怒至极，下令刑部从严处置所有涉案官员，一时间官场腥风血雨，人人自