与西汉相同的是，刺史也要周行郡国，查探政情，年终回京复奏。不过东汉的刺史不必亲自回京，而是派遣属吏向司徒府报送文书而已。
郡国
东汉共设郡国一百零五：王国二十七，司隶部属郡七，列郡七十一。除司隶部所辖七郡外，王国与列郡均分隶诸州，其中豫州领郡国六，冀州领九，兖州领八，徐州领五，并州领九，幽州领十一，青州领六，荆州领七，扬州领六，益州、凉州各领十二，交州领九郡。
东汉制度，皇子封王，以郡为国。每国置傅、相各一人。傅主王府事，职如汉朝的太傅；相如郡太守，主政务；相有长史一人，职如郡丞。另置中尉一人，秩二千石，职如郡都尉，是主管军政、缉捕盗贼的军官。
王府置郎中令一人，秩千石，职务和汉朝的郎中令相类似，主管王府的大夫、郎等；仆一人，秩千石，负责王府的车马训练与驾驭；治书数人，秩六百石，职如尚书；谒者数人，秩四百石，职务是奉王命出使；另有礼乐长、卫士长、医工长、永苍长、祠祀长等，秩皆比四百石。
郡太守秩皆二千石，只有河南郡因京师所在，长官称河南尹，位比九卿，秩中二千石。诸郡各置丞一人，位次太守，秩六百石，负责民政事务；边郡（就是设置在边境地区的郡）另置长史一人，秩六百石，负责军政事务。长史之下有司马一人，负责具体军事指挥。东汉内地不设郡都尉，以太守领兵。边郡置都尉或属国都尉领军并辖县，地位略与内地较小的郡相仿。如汉和帝永元元年（公元89年），置西河属国都尉、上郡属国都尉；永和十五年（公元105年）置辽东西部都尉；汉安帝置右扶风都尉、京兆虎牙都尉等。
县
东汉的县级地方建制与西汉相同。
列侯以县为封地则称侯国，侯国置相一人，相当于县令或县长（以侯国大小为异），相不隶属于列侯，但负责为列侯征收租税。封国户数在千户以上的，置家丞、庶子各一人，是侯府官，不管理民政；不满千户的，只置庶子一人。东汉的侯另有乡侯、亭侯，所封之地各为一乡、一亭，这样的封地辖于所在县，与乡、亭相等。
皇后、皇太后、公主的封地称邑，置令、长。邑的体制与侯国相当。
少数民族聚居地设道，隶属于郡，多设于巴、蜀等西南地区，以少数民族部落首领为道的长官。
万户以上的县置县令一人，秩千石；县丞一人，掌；县尉二人，掌治安。
万户以下的县置县长一人，秩三百石或四百石；县丞、县尉各一人。
东汉诸县出产盐的，置盐官，负责管理盐场、盐矿，征收盐税。出产铁的县置铁官，负责冶炼、铸造。在手工业发达的县置工官，负责管理工匠、征收工商税赋。在水产发达的县置水官，负责管理渔场、征收税赋。以上这些官吏不隶属于郡县，均隶属于少府，属于派出机关。
东汉在县以下的官制与西汉无异，具体可以参见西汉官制。
官职列表编辑
秩万石
即：月奉三百五十斛
上公：太傅、大司马（东汉末年于三公之外别置大司马，位在三公之上）
三公：太尉、司徒、司空
将军：大将军（大将军有时位在三公上，有时位在三公下）、骠骑将军
秩中二千石
即：月奉百八十斛
太尉领：太常卿、光禄勋、卫尉
司徒领：廷尉、太仆、大鸿胪
司空领：少府、宗正、大司农、
将军：车骑将军、卫将军、前将军、后将军、左将军、右将军
太子太傅、执金吾、河南尹、京兆尹、左冯翊、右扶风
秩真二千石
即：月奉百五十斛
后汉书未记载有“秩真二千石”及其官职，或言真二千石即为二千石。存疑
秩二千石
即：月奉百二十斛
地方长吏：郡守、州牧
诸王国属官：国相、国傅、（王国）御史大夫及诸卿
大长秋、太子少傅、将作大匠、度辽将军等诸杂号将军（骁骑、楼船、伏波、龙骧等）秩比二千石（月奉百斛）
少府属官：侍中、中常侍
光禄勋属官：五官中郎将、左中郎将、右中郎将、虎贲中郎将、羽林中郎将、奉车都尉、驸马都尉、
骑都尉、光禄大夫
北军中侯监领：屯骑校尉、步兵校尉、越骑校尉、长水校尉、射声校尉
将军部曲：大将军营五部校尉
诸王国属官：中尉
司隶校尉、属国都尉、使匈奴中郎将、护乌桓校尉、护羌校尉、城门校尉、都护将军
秩千石
即：月奉九十斛
将军府属官：将军长史、将军司马
太傅府属官：太傅长史
三公属官：三公长史
少府属官：御史中丞、尚书令
廷尉属官：廷尉正、廷尉左监
光禄勋属官：太中大夫
大长秋属官：中宫仆
太子少傅属官：太子率更令、太子家令、太子仆
城门校尉属官：城门司马、平城门屯司马
北军属官：屯骑司马、步兵司马、越骑司马、长水司马、胡骑司马、射声司马
诸王国属官：郎中