时间进入0090年，联邦政府的军力虽然在数量上已经恢复。但是在质量上依然无法与zaft的精锐部队相比。各地反联邦组织的活动也日益做大，为了维持军事上的威慑力，以脱离zaft后回归地球的布莱德-诺亚舰长为核心，配备精锐人员组建了外围独立机动部队朗德-贝尔队，提坦斯之乱后一直隐居在地球的英雄人物阿姆罗-雷。也接受老舰长的邀请加入了朗德-贝尔，急于用人的联邦政府直接将他提升为上尉。
0092年8月，有鉴于达喀尔的联邦议会总部在几次动乱中，被几大势力当成后花园儿一样随意进进出出的窘境，联邦议会将总部迁到了西藏拉萨。同年十二月，与格林普斯战役中跑路的夏亚出现在新吉翁，宣布成为新吉翁的总帅，同时对地球联邦政府进行了宣战，第二次新吉翁战争也就是夏亚之乱由此开始。
在朗德-贝尔队与新吉翁军队进行殊死搏斗之时，联邦政府却因为过度腐败收受了夏亚的贿赂，同时在多次动乱中形成的惧战情绪，相信了夏亚“吉翁军将会在3月12日解除武装投降”的谎言。而为了对抗实力强大的夏亚，阿姆罗也别向阿纳海姆公司定制的ms——x-93ν高达也在这个时候送到了朗德-贝尔队。
0093年3月12日，夏亚趁着联邦军放松警惕之时，指挥吉翁军一句夺回了阿克西斯，并将阿克西斯推向了地球，执行夏亚肃清腐烂政府，推动宇宙移民活动的“地球寒冷话作战”。布莱德舰长虽然指挥部队潜入了阿克西斯炸毁了其动力部，但是依然没能阻止阿克西斯坠落地球，而另一方面，阿姆罗和夏亚的决战也分出了胜负，本来缺乏与新人类ace对战经验的阿姆罗一直处于下风。但是关键时刻他福至心灵，在双方都弹尽粮绝之时，使出了拷贝自阿尼亚的萝莉控灭杀拳，成功勾起了夏亚当年在zaft留下的心理阴影，完成了喜闻乐见的绝地反杀工作。
但是此时阿克西斯的坠落已经无法阻止，为了拯救地球，阿姆罗驾驶着残破的牛高达妄图将阿克西斯推回去，战场上残余的双方战士也被其行为所感，一起加入了推行星的工作。但是阿克西斯已经彻底落入了地球引力井，几十台ms的努力不但没能阻止阿克西斯的坠落，反而因为大气摩擦的高热损失了不少。
就在危急时刻，也就是阿姆罗正准备爆种和夏亚同归于尽之时，一直躲在月面基地攀科技树的zaft再次强势登场。一台喷吐着青绿色粒子流，跟明显不属于现有科技体系的蓝白色机体从密涅瓦中钻了出来，在自动蒙上一层红光性能提升三倍不止以后，抬手出了一道令所有不知情人物都跌爆眼镜的粗大粒子束，并且以绝对不科学的威力一剑将阿克西斯斩为两半。之后密涅瓦配合着一大堆pēn_shè着红色粒子流的新颖ms，用阳电子破坏炮和威力巨大的奇怪粒子束将阿克西斯切成了毫无威胁的碎片。
此战中，蓝白色机体挥剑斩行星时释放的大量粒子在宇宙中构成了一道地球上肉眼可见的美丽虹光，这道虹光在之后被民间流传为“希望之光”，但是联邦政府却否认了zaft的参战历史，将阻拦阿克西斯坠落的的功劳全部算到了朗德-贝尔队的头上。此战的核心人物阿姆罗-雷和夏亚集体失踪，联邦政府确认了阿姆罗-雷的死亡，并将之追认为中校，但是民间却一直认为他和夏亚一起被zaft带回了月面。
之后除了月球圈之外，地球圈全境再次落入了地球联邦军的集权统治之中，为了拔除月面上的大钉子，以及应对那种战力完全不科学ms，联邦政府老老实实的攀着科技树，时间很快就在虚假的和平中过度到了0096年...