黄帝在位九十九年，其在位期间发明和建造了。历数、天文、阴阳五行、甲子纪年、文字、图画、著书、音律、乐器、医药、祭祀、婚丧、棺椁、坟墓、祭鼎、祭坛、祠庙、占卜等等。
此外黄帝还建立了古国体制：划野分疆，八家为一井，三井为一邻，三邻为一朋，三朋为一里，五里为一邑，十邑为都，十都为一师，十师为一州，全国共分九州。这也是中国有叫九州的由来。
设官司职，置左右大监，监于万国，设三公、三少、四辅、四史、六相、九德；共120个官位管理国家。
对各级官员提出“六禁重”，即“声禁重、色禁重、衣禁重、香禁重、味禁重、室禁重”，要求官员节简朴素，反对奢靡。提出以德治国，修德振兵，以德施天下，一道修德，惟仁是行，修德立义，尤其是设立九德之臣，教养百姓九行，即担任法官、后土担任狱官，对犯罪重者判处流失，罪大罪极者判处斩首等。
当然黄帝给后人印象最深的还是和蚩尤的大战。
蚩尤作兵伐黄帝。黄帝乃令应龙攻之冀州之野。应龙畜水。蚩尤请风伯雨师纵大风雨。黄帝乃下天女曰魃，雨止，遂杀蚩尤。
强悍善战的九黎部落，酋长蚩尤不服神农传位于黄帝；他有九个儿子，都是万夫莫当的勇士，附近部落都臣服在他的控制之下。于是对黄帝的有熊部落发动了战争。
黄帝好不退让挥军渡过黄河，一直挺进到九黎部落的根据地涿鹿。大战就在涿鹿郊野进行，两军胶着，不分胜负。蚩尤跟黄帝一样，也是大能转世，转世的自然是东皇的老对手祖巫帝江了，当然也可以说是新生。
他张开大口，喷出滚滚浓雾，三日三夜不散，有熊部落的士兵都迷失了方向。黄帝用大智慧发明了指南车，使他的部队虽在浓雾之中，仍能辨识道路。破解了蚩尤的大雾。
蚩尤见一招不成于是又向风神雨神求援，二神前来立刻刮起倒山拔树的狂风，降下瀑布般大雨，大地上波浪滔天，一片汪洋。一时间黄帝带领的军队一片哀嚎，苦不堪言。
黄帝之女被大水淹死了，却化作了旱魃。变成旱魃的帝女相貌狰狞可怕，眼睛生在头顶上，秀发全是一条一条的小蛇，身上长满白毛，所到之处，连一滴雨都不会有，往往一连大旱三年，赤地千里，所有生物，全部干渴而死。人们听到她的名字都会发抖。
然而在对战风神雨神时旱魃却是发挥了作用。她一出现，风神雨神就狼狈逃走，霎时间风停雨住，大水消失，泥泞干涸。姬轩辕乘机反攻，九黎部落大败。
蚩尤却不投降，手中虎魄刀舞动起来。和黄帝就是纠缠在了一起，黄帝一开始用普通的兵器对敌，皆被虎魄断了，其师广成子借仙宝居然也不能当虎魄。
当是时黄帝却想到了小夏送给他的轩辕剑，原本黄帝见轩辕剑外表华贵以为是见饰品，不想取来和虎魄一对竟然稳稳压制。
黄帝用轩辕剑斩了蚩尤，一举战胜了强大的九黎部落。
而小夏道长此时在黄牛部落中却是和丫头两手相握，慢慢闭上了双眼，第二天小二发现了已经没有气息的两人，一碰之下却发现两人的身体，却是化做点点星光消失不见了，桌上只留下了小夏道长留下的一封信。
小二拆开看到：“吾徒小二亲启。小二啊！为师历练红尘几百载了，能收到你和忘程也是有缘，如今为师带你师娘回山去了，勿忧勿念。有缘自会相见。若用麻烦，为师自会相助。”