这是对大明军队制度的一次巨大变革，以前的大明，士兵永远是士兵，即使立了战功，或者有优异的表现，也永远是士兵，绝对不能晋升为军官，最多获得一些物质上的奖励。
实行士官制度，给基层的士兵打开了一扇晋升的大门，尽管这扇大门现在只是开启了一条隙缝，士兵毕竟有了希望。
军官的军衔为三段十级。
副排长：少尉，肩章为一杠一星；排长：中尉，肩章为一杠两星；副连长、连长：上尉，肩章为一杠三星。少尉、中尉、上尉称尉级军官。
副营长：少校，肩章为两杠一星；营长、副团长：中校，肩章为两杠两星
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；团长、副旅长：上校，肩章为两杠三星；旅长、副师长：大校，肩章为两杠四星。少校、中校、上校、大校称校级军官。
师长、副军长：少将，肩章为金枝一星；军长：中将，肩章为金枝两星。
另外设立上将军衔，肩章为金枝三星。上将具备指挥数个军参加战斗的权力，相当于集团军司令，在战争时期，如果需要，可临时加封为司令，指挥大型战役。
根据崇祯年间的战争状况，以及平时指挥军队的能力，第一次设立六位上将军衔，分别是第一军军长袁崇焕、第四军军长洪承畴、第十四军军长左良玉、第十九军军长沐启元、第十三军军长祖大寿、辽宁省长孙承宗。
此外，国防院提议，崇祯帝为马上皇帝，为了更好地统帅全国的兵马，加封朱由检为大元帅。
对于这样的职务，朱由本来觉得无所谓，但他考虑到，大明军人的地位肯定会提升，如果士兵将来只认识自己的将军，不认识皇帝，将军们就可能拥兵自重，设立大元帅一职，让士兵与军官随时想到，皇帝、大元帅才是军队的最高指挥官，所以也就当朝接受了国防院的加封。
国防院做出解释，实行军衔制，并不是给士兵和军官加薪，前段时间大明进行了北伐和南征，战争结束后，对前线的将士除给与物质奖励外，还根据战场的表现评定了战功，但大明使用了新式火器，将士战死的情况很少，因此，军官升职一事就异常为难。
比如，一名旅长积累了战功，按律应该晋升为副师长，甚至是师长，但副师长、师长都在原位，其他军队也不缺副师长、师长，便无法安置这位应该晋升的旅长。
以前这种情况很少见，每次大的战役，大明即使获胜，也是惨胜，军官与士兵伤亡都十分惨重，甚至超过失败的一方，大明基本上是靠人数的优势在打仗，这样军官就会有许多晋升的空缺。
现在的大明，，依靠装备上的巨大优势，伤亡的情况很少，因此，建立战功的军官士兵难以得到升职，如果不能按律升职，就会削弱将士们为国立功的积极性，国防院这才设立军衔制。
建立军衔制，就是让那些获得军功、应该升职的将士，在暂时没有空缺时，先行提升军衔，等到有空缺的职务时，再行晋升，这就像文官的“候补制”。
大臣们听说军衔制只是相当于候补制，不用重新发放俸禄，甚至根本不用另外花银子，内心里也就没有多大的反对意见，朱由检爱折腾就让他折腾去，最好他将心思全部花在军队身上，朝政留给大臣们解决。
况且，他们刚刚封驳了军人的五等爵位制，朱由检心里一定还窝着火，在这无关紧要的问题上，就不要再触霉头了。
第二次军事改革的四项内容，有三项在朝堂获得通过，还有一项被大臣们初步否决，不过，也没有完全堵死，朱由检发现难以通过时，便以“稍后再议”为由，暂时回避了矛盾和冲突。
朝会随即转入下一项议题，财政部长毕自严，当朝汇报新的土地出售、耕地开发的情况。
（本章完）