“司法院？国防院？”大臣们念叨着，这两个名词，他们似乎没见过，自然不知道这两院具体分管的事务。
“司法院就是原来的刑部，负责审理全国范围内有影响的案件，院长乔允升，副院长唐济世，”朱由检止住大臣们的议论，“司法院独立行使审判权，其它两院不得干涉，就是政务院、国防院有人犯事，也得由司法院独立审判。”
“……”大臣们倒吸一口凉气，看来朱由检已经给断绝了官员贪墨的后路，司法院独立，官员们万一犯事，将来连个说情的都没有。
“司法院的下设机构，是各省的法院------省级也将改革，原来的提刑按察使司，更名为法院，法院不再受各省布政使的管辖，而是直接受司法院领导，独立行使一省的审判权。”
“陛下，大明的司法，完全独立成院？”
“不错，司法独立，不受各级行政官员的干涉，其实，官员们也干涉不了，各级法院的人事权、经济划拨权，都只受上级法院的管辖，”朱由检追问一句：“这算不算是对政务院的制约？”
“……”大臣们面面相觑，一旦司法独立，别说普通的官员，就是政务院总理，如果犯事，也只能将自己交到司法院的手上，不知道独立以后的司法院，与锦衣卫、东西厂有没有两样。
“当然，司法院本身也不能凌驾于大明的律法之上，他们在审理的时候，必须以律法为依据，监察部不能干涉，但可以监督，必要的时候，朕的锦衣卫，也会监督各级法院的审判工作。”
有了监察部的监察，大臣们稍稍放心，怎么说监察部也是政务院的人。
“对于政务院，朕还有一重制约，那就是国防院，院长李春烨，副院长王在晋，”朱由检稍稍停顿会，“国防院独立主管全国的军事，大明所有的军队，都直接受国防院的统辖。”
“臣多谢陛下的信任，臣肝脑涂地以报陛下！”李春烨在朝堂长跪不起，他已经明白了朱由检的内政设计，这国防院长，乃是与政务院总理、司法院院长齐名的三大高官，分工不同，又相互制约，而国防院长，掌控全国军队，实权似乎更大些。
“侯质平身！朕再说说国防院的组成，”朱由检向李春烨抬抬手，示意他站起来，“国防院除掌控全国的军队外，下设三个部：陆军部、海军部、参谋部。”
“陆军部、海军部、参谋部？”大臣们又开始议论，从名称上，他们能明白个大概，但是，对于参谋部，了解的人却是不多。
“众爱卿，陆军部长是阎鸣泰，海军部长是秦永年，这两部，分别掌管陆军与海军，至于参谋部，部长为曹文诏，”朱由检缓缓呷口香茗，“参谋部平时为军队制定军律和训练大纲，战争时期，给前线的军队提供军情，保障粮草、器械、后备兵员补充等，但不能调动和直接指挥军队。”
“陛下，这国防院，同样不受政务院统辖吗？”
“
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对，‘三院分立，互不统属，彼此分权，相互制约’，这就是‘三院十部制度’的基础。”
“朝廷机构如此设计，那陛下……”
“朕是大明的皇帝，自然要掌管整个大明，朕与政务院同掌政务权，与司法院同掌审判权，与国防院同掌军事权，此外，三院的主官，都是由朕直接任命，必要的时候，朕还会直接任命各部主官、各省省长、各军军长。”
“原来如此！”大臣们这才明白，朱由检还是凌驾在一切权力之上，果然是皇权至上。
“在不同的时间节点，朕的工作侧重点不同，今年，朕主要的精力，是在北五省的道路建设上，而明年，朕可能就要主管北五省的义务教育了。”
朱由检精心构筑的“三院十部制”，使朝廷有一个完整的框架，他自己可以完全从中繁琐的政务中解放出来，以皇帝的身份和威望，主抓某一项具体的事务，以点带面，促进大明的全面发展。
他还有一个设想，暂时还只能隐藏在自己的心中，按照这种体制，如果没有皇帝，朝廷照样可以正常运转，将来过渡到不要皇帝，或者皇帝不理政，也是水到渠成的事。
只有真正破除世袭，才有可能重振大明。
“陛下刚才说到的省级改革……”
“省级改革，首先，‘承宣布政使司’，蒙元的烙印太深，还是换成‘省’简洁，北、中、南共十五省，加上关外的五省，大明现在一共二十个省，但关外五省现在都是‘军管’，暂时不在改革之列。”
大臣们这才想起，大明现在已经不是原来的十五省了，这增加的关外五省，都是朱由检的杰作，难怪他有改革的手段与威望。
“省级地方行政机构的设立，与中央的类似，设省长、法院院长、总兵各一人，分别主管一省之政务、审判和后备役军备，他们分别由政务院人事部、司法院、国防院参谋部任免。”
“陛下，那一省之长，竟然管不了本省的募兵之事？”
“朕如此设立机构，不仅是为了让官员们相互制约，更是将省长从审判、军务中解脱出来，专门从事民政，努力提高百姓的生活水平，协助本省工商业的发展，改善本省的经济状况，”朱由检缓口气，“省长以下，比照政务院的十部，设立十个厅，各厅长由省长任免，对省长负责。”
“陛下，那府县呢？”
“府县比照省，设立相