当时远征军中可以参战的士兵已不足2ooo名，许多船只被暴风雨毁坏。于是德雷克决定从中挑选出2o艘坚固的舰船继续远征，让正在患病的诺里斯及部队乘坐其余船只回国。
德雷克舰队向亚尔群岛航行的途中被暴风雨吹得七零八落，旗舰“复仇号”也严重进水，经不起长途航行。罗伯特?克鲁斯和托马斯?芬纳率领几艘舰船被吹到南方遥远的马德拉群岛，他们在圣波多登6，并恣意进行了烧杀抢掠。
而最重要的目标财宝船队却毫无踪影。德雷克旗舰“复仇”号也历经艰辛才回到普利茅斯。这样，寄托着伊丽莎白女王和国民深切期望的远征军，最重要的战果只有汉萨同盟的6o艘运输船及其运载的货物，拍卖后共得3万镑。
一次绝妙的机会丧失了。而且，由于1589年7月法王亨利三世被刺杀导致的欧洲局势变化，英国近期内不可能再组织另外一支远征队了。
而无法重创西班牙残存舰队的情况下，在不到三年的时间，西班牙再次组织起一支实力相对而言更强的无敌舰队。
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