此刻被任命为首任西北军政总督的杜子成杜大将军可没有时间抒发豪情壮志，一方面利用第七集团军西调的机会，抓紧在陕甘宁扩兵备战，另一方面还得北上草原南防川蜀，西面剿灭青马残匪，内部抓紧绥靖地方。好在虽然名义上是军政总督，但是民政方面自有从山东回转的于右任于伯循主持，加上山东方面从青干院和山东大学的政法系毕业生中抽调了出身西北或者愿意到西北工作的青年学生干部和毕业生三百多人支援给他，在军队的贴身帮助下，用强硬手段先接管地方还是没问题的。至于和这些老油子坐地户们斗法，呵呵，有军队和无孔不入的情调处、统调处来帮助，顶多能在细节上有所斩获，若是动了阴招，就等着团灭吧，什么？罪名。这通匪的罪名套上去从来都是八*九不离十的，再从地窖里起出几件染血的贼赃啥的，就算是证据确凿，首犯交给法院审判，从犯们在庭外大多成了土匪受害者家庭成员的出气筒，在砖瓦石头雨中能活下来的都算老天开眼，命不该绝。一个个老牌家族的团灭，一场场暴烈的群众锄奸运动，杀得陕甘宁是人头滚滚，反正从度娘的名单里没有发现多少成器的人物，从经济性角度考虑既能减少社会危害，又能释放群众的暴戾，还能降低看押转化这些人渣的成本，顺便用这些血淋淋的画面去震撼教育其他的土豪劣绅，简直是超值的一件事情。
当然也有例外的情况，比如在偏远地区，士绅控制力度比起政府要强的多，所以山地部队的剿匪之路还在继续。一直到共和四年初，西北总督府命令驻岚皋的剿匪部队陕西治安军第七总队（团），迅速进军镇坪，完成陕西省最后一个县的解放。1月7日，由总队长秦金铎率三营七、八连和平利县巡防营，一营一连带重机枪两挺、01型步兵炮一门、60炮二门、电台一部在竹溪、白河两个县的巡防营的协助下，开始了收复镇坪的战斗。是日，由西北总督府联络处派回陕南做策反工作的王子绍等两名绅土做向导，从岚皋县城出发，沿岚河跋涉五天到达镇坪老城。此时，镇坪县的土匪早已逃入川、陕、鄂三省交界的鸡心岭一带。按照在岚皋设想的由秦队长和王子绍的名义，写信劝降的方案已难以实现，只好军事进剿。很快总督府的参谋首长又电示七总队，由老城向东南挺进，配合两郧分区和川北剿匪部队，三面压缩歼灭流窜之匪，以利地方开展工作。14日，部队从老城出发到达海拔3000米左右的大巴山鸡心岭，将土匪一部的前哨连歼灭于巫溪铜贯沟之三岔，又进至沙子岭，将其一部击溃。鸡心岭战斗后，七团七连又克土垭子上之匪，这股土匪的主力向元木沟方向溃逃。七连尾追不舍，消灭对方一个连。16日，七团一连、八连、团部和平利独立营到达元木沟与七连会合。这日下午，被围困在村北森林中的土匪二当家的周文礼及其亲信等200多人，携武器、战马向剿匪部队投降。17日，匪首柯玉珊带10多名残匪逃在一农民家里。根据老百姓的报告，总队长秦金铎命令一连连长工万昌带郭天成排立即去捉，俘匪30余人。唯柯玉珊腿部中弹后，自感身陷绝境，用手枪结束了罪恶的一生。这日，和柯匪混迹在一起的皖军少将参议夏修义率残部30余人，携枪向七总队投降。18日，镇坪县窝藏土匪的大户王吉占等30余人，由巫溪到元木沟向剿匪部队缴械。在剿匪部队攻击下，土匪残余逃遁房县。在歼灭柯匪，收复镇坪的战斗中，击毙击伤匪首柯玉珊及其他头目、连排长以下23人；皖军少将参议夏修义、皖军团长周文礼、大户王吉占以下349人投降；俘匪首领、皖军军官、医院院长、参谋副官、连长以下423人，缴获轻机枪13挺、75山炮2门、手枪133支、步枪450支、子弹2.5万多发、电台l部等。元木沟剿匪战斗的结束，镇坪县的解放，宣告了陕西省全境的解放。
除了剿匪之外，西北总督府还发出《关于剿匪后续工作的安排》。根据陕西南部秦岭山区剿匪工作进展，决定除由当地巡防营和陕西治安军再增派小队以上兵力分散驻守各地要冲以加强武装力量外,眉县、岐山、宝鸡、凤县、留坝、佛坪、周至等七县,必须按自己在该山区人口的多少,抽调足够数量的丁壮参加到当地治安巡防队