百姓惶惶不安，每日都有有偷偷越城墙而去，就连士兵也有悄悄溜走的。杨秀清知道了大惊失色，连忙命心腹接管城防，凡有越城而逃着，一律格杀无论。如此一举更让杨秀失却民心，军心更是不稳。杨秀清杀天王洪秀本就没有多少支持者，全靠武力支撑着。如今天国覆灭在即，谁不想给自己留条后路。许多天军将领密秘商议，私下里遣人与清军谈叛。杨秀清，军心民心几乎尽失，却不自知仍自在天王府花天酒地，幻想天下一统的美梦。
南京被围之时，石达开正在广西大山之中与广西清军游击战。由于广西是天军发源地，民众基础很好，地形又险要。清军根本无法捉摸到石达开的足迹，加上又有百姓自愿为天军报信。石达开不但未因此而损失实力，而且借着天军声势将原本只余三万余的部队瞬间扩充至十万余人。
得天扬州，九江被破，南京被围，清军重兵云集南京的消息之后，石达开也开始酝酿着自己的出路了。他知道现在是他最后的机会，借着清军主力全部集中在了南京对付杨秀清，广西周边并无多少清军的兵力，现在是石达开进入四川，借四川以为根本的唯一机会。
若等到南京也被破，清军大军南向，石达开想要冲出广西都难了。于是石达开于咸丰五年九月开始准备着战前事宜。着部下四处收购粮草，可是广西贫困已久，任是他怎么收购，也所有有限。这也是石达开非要冲出广西立足四川的根本原因之一。
九中旬，石达开率部十万，出广西发动了宝庆汇战，岂图先占宝庆，摒除后顾之忧，再以重兵力，轻装北上再入湖北，由湖北入川。可是他没有想到的是，并不是清军没有兵力入广西剿灭他，而是广西大山实在太大，清军根本没有办法抓住他的踪迹，老对头曾国藩其实就等老石自投罗网，在宝庆四边布下重重包围，借势一股作气，歼石达开于城下。
而且，驻守两广的左宗棠也早已得到咸丰的命令，石达开不出广西则左宗棠不入广西，若石达开出广西，则左宗棠速尾随其实，断其退路，务必使石达开进退无路，乖乖就范。左宗棠先自有些奇怪为什么皇上这么肯定石达开会好好的根据地不呆，非要去四川？四川好是好，可惜如今先机已失，若是他自己，左宗棠打死也不会出广西，乖乖呆在广西根清军打游击，慢慢发展势力。
当石达开率部十万浩浩荡荡自桂林出发，沿湘黔边界杀往宝庆的时候，一直守在石达开屁股后面迟迟未动的左宗棠立马挥军入广西，以迅雷不及掩耳之势瞬间攻下石达开在广西的根本重地桂林，以及庆远，并尾随败军之后，将石达开入广西的路全部封死。
而曾国藩则命令湘军全部快速散于宝庆各地，等候石达开的到来。曾国藩千辛万苦一路如吊死鬼一样的追着石达开不放，一方面是为了屡败于石达开之下的仇，他心有不服，一方面是因为咸丰的一道要活的石达开，不要死的石达开，让曾国藩心领神会的知道灭发贼的重点不在南京，而在石达开身上。