可是后来没想到，顾宪成反对的不是张居正，而是大明朝的内阁。张居正倒了，换了太平宰相申时行，也要被顾宪成骂，旧法的拥护者王锡爵，也一样跑不了。这时候万历才认清，顾宪成只是敌人的敌人，但不是自己的朋友。再加上他跳出来攻击郑国宝，自然要被皇帝借题发挥，干掉拉倒。
“当初参劾哱拜的人里，也没少了顾宪成。可是朕一让他拿出可行的办法，如何搞掉这个边关上的老货，他便没了下文。这种人只知道提出问题，却不知道该如何解决，朕要他有什么用？还是内兄这好办法一出，既复了前套，哱家也元气大伤，前些时哱拜加都指挥使衔拜为大同副总兵，着令他即刻上任。这在以往，根本不可能，结果他见了圣旨，乖乖的得去上任。等到了大同，他人生地不熟，还如何称霸？哱承宠留在宁夏，也改了闲职，他家再难为害，河套用那些骄兵悍卒打下来，得利的是朝廷。朕就奇怪，顾宪成这个时候跳出来指责不该擅开边衅，不该随意开战，让他拿个解决的办法，他又拿不出来，却要朕听他的话，这到底凭的什么？”
等郑国宝又说了河南平乱之事，万历更是怒道：“这干清流前写天还有脸来，为顾允成求典恤。当真不知羞耻二字！好好的一个河南，就是糜烂在他们手里，他们还有理了？顾允成死了就死了吧，什么也没有！若是他没死，朕还要治他的罪呢！这干文官的话，便信不得。他们话里话外，居然还说若男的不是。说要不是清查镇嵩军，就不至于有此兵变。怎么不说，若不是他们保举了顾允成这个混球，河南压根就乱不了呢。内兄，你与我说说，这河南地面，如今到底是什么情况？”