限于万宝儿的身份与剧情人物毫不相干,为了争取获得隐藏包裹奖励，思来想去，万宝儿还是决定先除掉新月最重量级的拥护者以及博果尔升职最大的拦路石——孝庄。只有孝庄死了，后宫的权利格局才会大动，她也可以利用太妃的身份从中周旋一番。于是，就在新月住进努达海的将军府那一日,万宝儿夤夜拿出了自己这几年练习驭蛇术的成果，放了一条毒蛇潜入皇宫中。
第二日，就听宫里传说皇宫竟然跑进了一条一米来长的绿色大蛇，也不知是怎么的就趁晚上从窗口顺着房梁爬进了慈宁宫,太后被大蛇给咬了，现在生死不明。万宝儿心说孝庄也算是命大了,普通人若是被这蟒山烙铁头咬一下,怎么也撑不到第二天，难道真是凤体天命？虽然孝庄仍是在太医的救助下撑了两天，但还是在第三天的早上就此去了。
福临万分悲痛，不管怎么说，太后都是她的母亲。虽然他们母子关系紧张，但感情终归还是有的。孝庄的遗体在慈宁宫中停灵，朝廷内外命妇，宗亲大臣皆前来叩拜哭灵，可直到四十九天过去了，福临仍旧迟迟不肯将太后下葬。最后，福临在朝堂上说出了他要为母亲单独建立一个孝庄文皇太后陵的决定。
按理说，太后身为皇太极的嫔妃，理应随葬于皇太极的陵寝。可福临知晓自己皇额娘和皇阿玛之间的感情历来不好，皇阿玛最心爱的女人是海兰珠。也知道皇额娘当初与摄政王的确有了夫妻之实，不管是为了什么，这已经发生过的事情无法更改。相信皇阿玛如果在天有灵，也不会希望跟皇额娘葬在一处。而皇额娘，大约也是不想再见先帝的吧。
福临力排众议，将孝庄的遗体转到了遵化昌瑞祖陵，将慈宁宫中太后惯用的物事都运送过去，建了一个暂安奉殿，以供棺椁停放。随后，便开始着手为母亲修建单独的孝庄文皇太后陵寝，只待完工之后，便可迁陵。
孝庄去了以后，举国朝政，各方关系的压力都落在了福临一个人的肩膀上。福临又没有孝庄那般圆滑的手段，面对压力的反应是越压越反弹。竟然在孝庄死后的半年，就在上朝的时侯下旨决定再次废后。如此一来，刚刚稳定的蒙古又沸腾了。
福临对待国事是个没轻没重的，少了老道的孝庄压着他、管着他，他就如同脱缰的野马一般完全失控了。如今太后走了，太妃成为了后宫中资历最老，地位最权威的人，而且又同是蒙古博尔济吉特氏，不免就有人求到了太妃面前，请求太妃进宫去规劝皇上，收回旨意。
太妃本来不乐意管福临的，但是一想到若是蒙古乱了，那整个大清岂不是也岌岌可危了。南方那些反清复明不断的闹，川地十三家军也仍旧不消停，再加上乌苏里台、噶尔丹等地也需要收复......就连太妃这么个从不懂朝政的女人，也明白此刻大清绝对不能失去蒙古的支持，也绝对不能废了皇后。
万般无奈之下，太妃还是进宫见了福临。刚一看见人，张口就道：
“皇上，你究竟闹够了没有？我可不是太后，也没那个义务纵着你的性子。现在蒙古因为你一句话就要乱套了，天下尚未平，后院又起火，你打算怎么办？如何维系我大清江山？”太妃说话永远是直来直去的，不管面对谁，也不给任何人留面子。
福临没有说话，其实他自己都不知道该怎么办？他只是想自由一回，把当初太后在时想做却不能做的事情都做了，不计后果。可这大清江山，毕竟不是福临一个人说了算的。就算没有太后，也还是会有别人的......福临此刻方才无比清晰的认识到，原来挡在他面前的不是太后的私心，也不是什么朝廷老臣的掣肘，而是无比残酷的现实。
“太妃，你回去吧。”福临闭着眼睛，无力的说道。
“朕，不废后了......”
福临瞎折腾了一番，可最后一切还是回到了原点。只是福临的心境却再也回不去了，他显得苍老了许多，失去了以往的灵气和不服输的精神，仿佛一滩死水。他开始越发的向往出家，越来越少的关注国事，总是拈着佛珠，拿着佛经看得入神。
博果尔对此很不理解，在他看来，谁当皇后难道就这么重要吗？皇兄不喜欢皇后，大可以不去她那里就好了，反正他也一直是这么做的。新皇后为人安静愚钝，又不像静妃那般爱闹，就当皇宫里没这个人不就行了。
万宝儿闻言不置可否，也许只有她才能明白，福临心里真正介意的不是谁当皇后，而是他身为男人的尊严和权利。他是天下至尊，可是他这个至尊只是表面上看着华丽罢了。改革的新政遭受打击，尽管太后去了，可阻力依然存在。孝庄的死是点燃福临内心压抑的导火索，福临再度废后是他的爆发，若是成功了，他可能会到达另一个思想境界，可偏偏又因为蒙古的存在而失败了。福临是一个太过理想化的完美主义者，所以他就此一蹶不振了。
由于太后去世，当今皇后又是个不管事儿的，所以太妃只好硬着头皮临危授命，在福临的委托下，天天带着万宝儿一起进宫查看处理后宫各项事宜。太后以前是知道吴良辅和佟妃之间对食的那点子事儿的，但是由于太后对玄烨很看好，于是也只能闭口不言。可太妃跟太后不同，她眼里揉不得一颗沙子，吴良辅的恶行一经发现，太妃立刻就发难了，将吴良辅扭送到了福临面前。
福临听说佟妃为了让玄