这说明原先尊奉“国主”的大批将士在关键时刻是识大体的，不应心存畛域，加以歧视和打击。
可是，李定国却缺乏广阔的胸怀，采取了一些歧视原属孙可望部下将士的错误做法。
李定国和永历帝把刘文秀和主要将领召回昆明，使文秀的善后工作未能有效进行已是重大失误，对文秀的乱加指责更使他心灰意懒。
被召回意味着被解除兵权，朝廷在晋、蜀二王之间已明显地倚重李定国，一些目光短浅的举措又让文秀深为不满。
他内心非常苦闷，甚至私下对人说：“退狼进虎，晋王必败国。”把李定国比作孙可望第二，失之偏激，但他对定国大权独揽和处事不当表示反感大体上是正确的。
这以后他日趋消极，凡大朝日始上朝一走，常朝日俱不去，将一切兵马事务悉交护卫陈建料理，亦不出府。
不久，刘文秀发病卧床不起，永历帝和李定国都曾去探望，再三宽慰，派医调治。但心病无药医，永历十二年四月二十五日，文秀病逝。
临终前，文秀上遗表云：“虏兵**，国势日危，请入蜀以就十三家之兵。臣有窖金一十六万，可以充饷。臣之妻子族属皆当执鞭弭以从王事。然后出营陕、洛，庶几转败为功。此臣区区之心，死而犹视者也。”
他死之前虽然仍记挂着蜀事，但他心中清楚，此生他最负蜀人。