海瑞主张不拿百姓一针一线，走基层下乡，自备饭食；官吏到下面检查，地方官员迎接，酒菜必须有定制；杜绝公款吃喝，严禁大吃大喝。
可以说海瑞的思想是超前的，也是划时代的，也是他不被认可的地方。
朱由校记得很清楚，张居正倒台之后，明神宗朱翊钧向来器重海瑞的名望，于次年正月召海瑞为南京右佥都御史。
赴任途中，改为南京吏部右侍郎。
海瑞当时已经七十二岁了，上疏言衰老垂死，愿意效仿古人尸谏的意思，列举明太祖朱元璋刑法，剥人皮装上草制成皮囊，以及定律枉法达八十贯判处绞刑的规定，说应当用这样的方法惩治贪污。
其它谋划时政，言语极为切实。
只有劝皇帝用暴虐刑法，当时评议认为是错误的。