建始元年春正月乙丑，悼考庙火灾。
石显迁长信中太仆。秩禄为中二千石。
石显既失倚离权，于是丞相御史条奏石显旧恶，及其党牢梁陈顺皆免官。石显与妻子徙归故郡。忧愤不食，在道上死去。那些因为交结石显而得官的，都罢官归家。少府五鹿充宗左迁玄菟太守。御史中丞伊嘉为雁门都尉。司隶校尉涿郡王尊，劾奏丞相匡衡，御史大夫张谭，明知石显专权擅政，大作威福，为海内患害，不及时白奏行罚，而阿谀趋奉，附下罔上，怀邪迷国，无大臣辅政之义，在赦令前不举报，在赦令后才开始举报，而且不自陈不忠之罪。反而扬著先帝任用倾覆之徒，妄言百官畏惧他们甚于畏惧主上。卑君尊臣，非所宜称。失大臣之体。
于是匡衡惭惧，免冠谢罪。上丞相侯印绶。天子以新即位，王尊重伤大臣，左迁王尊为高陵令。然群下多以为王尊所言确实如此。匡衡嘿嘿不自安，每有水旱，连乞劾骨让位。皇上都以诏书抚慰，不许。
立故河间王刘元弟上郡库令刘良为河间王。有星孛于营室。赦天下。
壬子，封舅诸吏光禄大夫关内侯王崇为安成侯。赐舅王谭，王商，王立，王根，王逄，王时爵关内侯。
夏四月，黄雾四塞。下诏博问公卿大夫，不要有所忌讳。谏大夫杨兴，博士驷胜等，皆以为是阴盛侵阳之气，高祖之约，非功臣不侯，今太后诸弟，皆以无功封侯，这是以前外戚没有的事，故天为之出现异象，于是大将军王凤惧，上书乞劾骨辞职，皇上优诏不许。
御史中丞东海薛宣上疏说：陛下至德仁厚，而嘉气尚凝。阴阳不和或许是吏多苛政，部刺史或不楯守修职，举措各以自己的意见为旨，以至于开私门，听谗佞。以求吏民之过谴。求备于细微，责义不量力，郡县互相迫促，内相忌刻，以至于流及百姓，以致乡党猜忌，人道不通。如此则阴阳阻隔，和气不通，未必不是因为这事。诗经说：民之失德，乾餱以愆。鄙语说：苛政不亲，烦苦伤恩。当刺史奏事时，应该明申约束，使他们昭然知道本朝要务。皇上嘉纳之。
八月，有两月相承晨见东方。
冬十二月，作长安南北郊。罢甘泉汾阴祠。及紫壇伪饰女乐等。
二年春正月，罢上雍五畤及陈宝祠。这是从匡衡之请。
辛巳，皇上始郊祀长安南郊。大赦奉郊之县。及中都官狱耐罪以下刑徒。减天下赋钱四十。
闰月，以渭城延陵亭部为初陵。三月辛丑，皇上始祠后土于北郊。丙午，立皇后许氏。许后，是车骑将军许嘉之女。元帝伤感于母亲恭哀后居位日浅，而遭霍氏惨毒，故选许嘉之女以配太子。
皇上自为太子时，就以好色闻名。及即位，皇太后下诏广采良家女以备后宫。大将军武库令杜钦，对王凤说：依礼一娶九女，是为了广嗣重祖。侄弟虽缺不复补，是为了养寿塞争，因此后妃有贞淑之行，则胤嗣有贤圣之君。制度有威仪之节，则人君有寿考之福。废而不用，则好色之甚，好色之甚，则寿命不究于高年。男子五十，好色未衰，妇人四十，容貌改于以前。以改前之容，侍于未衰之年，而不以礼为制，则其势不可救。就会为后来者改变态度，一旦态度改变，正后就会自疑。而支庶就会有离间正适之心。是以晋献公被纳馋之谤，申生蒙无罪之辜。今圣主富于春秋，未有适嗣，方向术入学，未亲后妃之议，将军辅政，宜因初始隆恩，建九女之制，详择有行义之家，求有淑女之质的人，不必有声色技能，只有这样的人才可为万世大法。人在年少时应该戒色，诗小雅所记小卞之事（小卞讽刺周幽王废申后而立褒姒黜太子申生的故事），实在令人寒心。希望将军常以此为忧。
王凤告诉了太后，太后以为故事没有这回事，王凤不能自立法度，只需遵循故事就可以了。
王凤素来看重杜钦，因此将他安置在自己的莫府之中。常和他一道讨论国家大事。多次称达名士，补正缺失，当世善政，大多出于杜钦的谋划。
夏，大旱。匈奴呼韩邪单于嬖幸左伊秩訾兄女二人。长女颛渠阏氏，生二子，长子名切莫车，次子名囊知牙斯。次女为大阏氏，生四子，长子名雕陶莫皋，次子且靡胥，皆长于切莫车。少子咸乐二人，皆小于囊知牙斯。又有其他阏氏之子十余人，颛渠阏氏贵幸，切莫车受宠。呼韩邪病将死，欲立切莫车为后，颛渠阏氏说：匈奴战乱十余年，不绝如发，幸亏赖大汉之力，才得以复安。今平定未久，国家仍未太平。切莫车年少，百姓未附。恐怕再次使国家倾危。我与大阏氏一家共子，不如立雕陶莫皋。大阏氏说：切莫车虽年少，有大臣共持国事，今舍贵立贱，后世必乱。单于从颛渠阏氏之意，立雕陶莫皋。与他约定将来传位于弟。呼韩邪死，雕陶莫皋立，为复株累若鞮单于。
复株累若鞮单于，以且靡胥为左贤王，切莫车为左谷蠡王。囊知牙斯为右贤王，复株累单于复以王昭君为妻，生二女，长女为须卜居次。小女为当于居次。
三年春三月，赦天下囚徒。
秋，关内大雨四十余日，京师民众互相传言大水至。百姓奔走，相互践踏。老弱号呼，长安中大乱。天子亲御殿前，召公卿计议。大将军王凤，以为太后与皇上及后宫可暂上御船避水。令吏民上长安城避水。群臣皆从王凤之议。只有左将军王商说：自