涿鹿之战千年，巫人有不周巫界支持，与人族正统仙军大战，两方不分上下，最难应对的还是蚩尤。
好在还有克制之法，伏羲从三祖圣地讨来破碎之后的屠巫剑碎片，轩辕以此铸造了一柄轩辕剑我，此剑能破九黎蚩尤巫体，但还不够。
人族内战，引来多方关注，昊天更是派了自己与瑶池生的女儿九天玄女下界，为功德气运也是拼了，玄女与轩辕成亲，轩辕登上共主后成了天帝女婿，天帝早在人族内战爆发时，就派了十位大罗金仙保护九天玄女。
轩辕一介凡人，寿合长了点，为了应对蚩尤，轩辕不得不请动自家老祖，存在于仙庭界的仙帝，公孙轩辕仙帝。
涿鹿之战最后爆发，公孙轩辕手持轩辕剑在交战中将蚩尤头颅斩下，可为蚩尤却未陨落，最后公孙轩辕用轩辕剑将蚩尤斩成多块。