大明崇祯十二年，公元1639年12月，马尼拉港。
一艘头尖体长，上宽下窄的广船从被鲜血染红马尼拉湾中驶出，在这艘名为‘涌金儿’的广船身后是火光冲天的港口，华人聚居的‘涧内’已经笼罩在一片烈火之中，房屋和船只在燃烧，火光之中，到处都是绝望哭嚎的华人，他们奔逃着，呼喊着。
不远处的圣地亚哥堡，不断亮起一团团的橘色火焰，那是西班牙殖民者正在用火炮轰击，而在港口，华人在四散奔逃，追杀他们的有手持火绳枪的西班牙人，挥舞倭刀的日本切之丹武士，还是趁火打劫的菲律宾土著，他们手持利刃身披铁甲，如猛兽豺狼一样横扫过来，把华人砍倒、刺穿、驱赶下海，烈火照耀了大地，鲜血染红了海洋，将马尼拉变成了华人的人间地狱，即便是黑夜，也难以掩盖这恶魔一般的罪恶。
“报仇为我们报仇。”被追杀到岸边的华人看到了逃出港口的涌金儿号，绝望的呼喊着。
涌金号的船艉楼，船长林诚指关节攥的发白，却终究没有下令返回，他捂住自己的眼睛，强迫自己扭过头去。
1639年的冬日，马尼拉的西班牙人第二次对华人进行屠杀，因为三十多年前的屠杀没有付出任何的代价，这一次的屠杀更加的肆无忌惮，并且一直持续了四个月，至少有两万华人在这次屠杀之中丧命，其中包括了不少已经皈依天主教的华人。
嘎吱嘎吱嘎吱。
李明勋的耳边全都是木材摩擦产生的嘎吱声音，空气是夹杂了尿骚、汗臭和发霉的异味，身体在随波摇晃，好像无根浮萍一般，而脑海之中却回忆着这一个多月来的生活。
一个月前，作为一个历史军事爱好者的林明勋从大连海军舰艇学院毕业，正是成为海军的一员，并且随舰队远航亚丁湾，却在经过菲律宾的时候被突如其来的风吹下了舰船，等醒来的时候，已经穿越到了崇祯十二年的马尼拉。
粗粝的食物、繁重的劳动和恶劣的生存环境将一个穿越者的雄心壮志折磨殆尽，正当他准备先安分守己一段时日，再想办法转变的时候，就遇到了发生在1639年冬天的这场大屠杀，正是因为李明勋冒着杀头的危险向船长林诚发出警告，才免于被杀的命运，然而事发突然，也只解救了涌金一条船罢了。
在记忆的最后一颗，李明勋被实心炮弹击断的桅杆砸中了脑袋，就此昏迷。
“报仇报仇！”一团乱糟糟的声音钻进了李明勋的脑袋里，让他再也无法保持安静，那声音凄惨至极，又充满不甘，渐渐远去。
李明勋瞬间清醒过来，猛然坐起来，却直接撞在了一块木板之上，额头剧烈的疼痛让他大叫一起，把记忆中的火焰和哀嚎彻底驱离，他嗅了嗅空气中的味道，确认自己在海船上，但是眼前却是一片昏暗，身体则是被困在一个狭小的区域内，他伸手一摸，四面八方都是木板，用力向上一推，才推开一条缝隙，涌进来更加污浊的空气，而眼前则出现一双如牛铃大小的眼睛。
“难道我死了？”李明勋心中泛起了嘀咕，但是感知却是那么的清晰，接着微弱的光线，他看清了那双盯着自己看的大眼睛，这哪里是牛铃大小的眼睛，分明就是牛的眼睛。
这个时候，一阵嘈杂的声音响起，一盏微弱的灯光自远及近，接着便是一张笑脸出现在了李明勋的面前，是一个十二三岁的孩子，正咧嘴笑着：“李先生，你没死呀，我们还以为你已经死了，把你放在我老舅的棺材里了呢。”
这孩子李明勋认识，正是当初把自己从海湾里救上来的海主林诚的外甥，与自己同姓李，却因为年纪小，没有大名，众人唤其为阿海或者小掌柜，在马尼拉一个多月里，阿海对李明勋最为照顾，虽然目的是想学李明勋的本事，但着实帮了李明勋不少忙。
被阿海扶起来，李明勋才知道自己真的被安置在棺材里，一问才知道，原来是被桅杆砸晕之后，众人以为他死了，但毕竟是李明勋提早告知，才逃出魔爪，也不忍弃尸大海，便搁置在了海主林诚自己备置的棺材里，而棺材正是在底舱，周围要么是压舱的石头，要么是圈养的一些牛羊。
“小掌柜，大掌柜听说李先生醒了，请他过去呢。”一个穿着短衣的男人走下底舱，说道。
阿海笑了笑：“知道了，不消一会便过去。”
敷衍那男人走后，阿海忙活起来，和几个半大小子一起，端来了热粥还把刚挤出的牛奶掺进去，打进去一个鸡蛋，阿海说：“先生快快先喝了吧，这是给我老舅准备的，你若不吃，一会该没了。”
李明勋笑了笑，昏迷了一天一夜，倒也真的饿了，连忙吞咽了下去，虽说牛奶略腥，在海上却是难得的美味了，海上的艰苦是人人都知道的，在十七世纪的海上，尤是如此，只有船长等少数高级军官才能享受舰船上圈养的鸡鸭、牛羊所产的蛋奶，这在东西方倒出奇额相似。
吃饱之后，李明勋爬过狭窄的楼梯口，上得涌金的上层甲板，看到茫茫大海，李明勋心情舒畅了一些。
林诚原本是广东的普通海商，后来因为郑芝龙独霸中国沿海，林诚不愿意投靠，只得去了马尼拉，常年在漳州、马尼拉和大员港之间跑船，十几年来积攒了不少家财，船队更是得到了扩充，拥有沙船、福船和广船十几艘，算是华人之中实力不弱的海主了。
此次马尼拉大屠杀，林诚也仅