朱有孝没有想到李信这家伙这么能折腾，然后就把和乌斯藏谈判的权利交给了李信。于是，李信就代表明朝朝廷和乌斯藏高层进行了谈判，双方约定在四川的安康进行会谈。
乌斯藏提出的条件是可以以目前的区域为终点，划分双方的分界线，李信不得继续向西南发展，乌斯藏也不再向明朝的青海地区骚扰，双方不在产生敌意。李信直接就拒绝了这个方案，告诉他们，乌斯藏是大明朝的一部分，必须接受朝廷的改土归流政策，无论是活佛，只有传教的权利，都没有统治地方的资格，贵族们管理地方必须接受朝廷的任命，否则就是非法的，必须废除农奴制度、土司制度。
双方的条件差距太大，很快就谈崩了，谈崩的结果就是战争，乌斯藏开始调集队伍准备开战，李信仍然是信心十足，丝毫不在意。首先是直接组织在川藏地区的藏民农奴分地，然后告诉他们，有朝廷给你们撑腰，也需要你们自己保护好分得的土地，要想过上好日子，就得推翻乌斯藏贵族的统治制度，否则只能还给土司、农奴主们干活，孩子老婆包括你自己都是农奴和奴隶。已经享受到自由的农奴们，谁还愿意整天被别人打骂和奴役。其次就是组织藏民的武装民兵，发给他们一些武器，再配合自己的两千火枪兵，就开始了解放农奴的战争。
乌斯藏的区域不小，但是人口有限啊！他们能组织多大的军队呀，更何况洪承畴在青海的血腥屠杀早就让乌斯藏人胆寒，这也是乌斯藏贵族们愿意退出的原因。李信就在康定组建了不到一万的武装民兵，配合两千火枪兵开始了和乌斯藏的战争。
战争进行的非常简单，农奴们早就不满贵族们的残酷政策了，每到一处土司、贵族们的庄园，武装民兵就直接杀死他们，分掉土地和粮食，然后带上一部分给养和少部分青壮，就继续向下一个目标前进。遇到前来镇压的乌斯藏武装，李信就先让武装民兵喊话，先讲乌斯藏贵族的罪恶，再讲朝廷的好处，分田地、分粮食、不纳粮、不交税，以后的生活就是自给自足，挣了的全是自己的。这种洗脑的思想工作一做，谁还会为别人卖命啊！小点的军队直接就溃散了，根本就不用打，干嘛？都回家分地分粮食去了。
唯一的一场算是大点的战斗吧，是在昌都发生的，近两万人的乌斯藏军队和李信的武装民兵展开了对峙，这些人被贵族们洗了脑，又是从较远的地方来的，喊话的效果一般，只是让他们犹豫了一下，接着就冲了上来。李信笑了笑，一挥手，三十门小迫击炮开始排射，从来没有见过这些东西，也没有什么进攻章法，只是一群一拥齐上的乌斯藏军队，立马就伤亡一大片，更主要的是心理上接受不了，接下来的有一定组织训练的武装民兵上阵，刹那间乌斯藏军队就溃散了，从此以后再也没有组织起来。
李信的武装民兵队伍越来越大，解放了的农奴很多在分了田地以后，就自动的牵着牦牛和藏马跟在队后协助进军。因为这些武装民兵都是乌斯藏人，他们对于气候没有任何不适应，所以李信的乌斯藏之途没有任何压力，后勤更不用考虑。
当李信到达乌斯藏的都城的时候，城门大开，没有任何人抵抗，贵族们都逃到藏南去了，两大活佛也都被他们裹挟而去，满城的都是普通的老百姓。李信让从昌都来的小活佛暂且主持这里的宗教事物，让最早跟随的乌斯藏人自己从武装民兵里选出领头人，开始代替政府工作，远处的暂且不予理会，就把武装民兵训练了一个月，然后开始进军藏南，在整个乌斯藏地区，那里才是最精华的地方。
进军藏南后遇到了一点小麻烦，碰到了廓尔喀人，他们是笃诚的佛教信徒，为了保护他们心中的活佛勇猛的抵挡着李信的部队，万般无奈的情况下，李信只好不惜代价把他们诱入山涧，用迫击炮解决了他们，但是也失去了三千多人的武装民兵。为了避免更多的人死亡，李信又给了他们一次谈判的机会，犀利的小炮震住了活佛，为了保住性命，不得不接受了李信的条件。
随着藏南的收复，李信彻底对乌斯藏进行了宗教的改革，对地方的管理机构也进行了整治。首先就是佛教可以自由的传播，但是寺庙的人们不得要求信徒捐赠财物，不得干涉地方事务，可以拥有平均田地不超过两倍的数量，接受信徒捐赠的财物必须清楚登记来龙去脉，并且不允许浪费、贪污。
针对于乌斯藏地区恶劣的气候原因，李信根据朱有孝的旨意，五年内不在乌斯藏地区征收任何税费，地方官员的薪俸也由朝廷开支，地方政府机构可以拥有不同数目的土地，暂且用来应付管理机构的日常费用，矿山、土地属于国家所有，不得私自买卖。
朱有孝当然不会做亏本生意，随着乌斯藏地区的收复，大明皇家贸易商行也开进了这个地区，凭着牛金星这个变态的商人智慧，乌斯藏地区的各种特产源源不断的被运了出来，而其他地区的商品也是源源不断的进入这一带地区，凭这些来回买卖的商品，就完全可以赚回支付官员们的薪水的。
李信收复乌斯藏以后，朱有孝就直接任命他为乌斯藏总管，让他在拉萨训练一只藏兵，人数在一万多一点就行，因为下一步朱有孝如果要政府天竺的大部分区域的话就需要一些能够适应高原气候的兵马。在喜马拉雅山脉两侧进行作战可不是一