不过到了这个时候，科技树的科技补全计划就变得慢了起来。毕竟越往上走，科技树的分支就越多，知识量也更大。就算以杨奇的超强能力，也无法将所有知识全部掌握，所以到了这个程度后，更多的知识其实是被科技推演系统推演出来的。
有了前面的科技基础，在杨奇的主持下，大量的科学技术被系统推演出来，继续补全着科技树上的空缺。有了杨奇的主持，科技推演系统少走了绝大多数的弯路，开始发挥出它真正的作用。几乎在每一个时刻，都有大量的科学技术被推理出来，并出现在科技树上。如果在外面的世界，这些科学技术的获得将耗费大量的人力、物力和时间，而在科技推演系统里，只要基础打好了，有了正确的推演方向，这些科学知识的获得将变得轻而易举。
在看见科技的进步速度之后，燕飞就自愧不如，科技推演系统在他的手里很长一段时间里，但是根本就没有发挥出什么作用来。但是在被杨奇操控之后，马上就展现出神奇的一面，取得了重大研究成果，果然专业的东西在专业人士的手里才会发挥出最大的作用。
陆萍萍从国内接走杨奇父母的时候，并没有告诉他们杨奇的真实情况，所以杨奇的父母是带着悲伤的心情来到雾隐岛上的。但是让他们惊喜的事情发生了，在雾隐岛上，他们居然看见了自己已经失踪的儿子。虽然现在的杨奇又恢复到了之前那种痴痴傻傻的模样，但是好歹是安全的，说话也变得有条理多了。
杨奇的父母赶到雾隐岛后，燕飞就在自己家附近整理出一栋房屋，让杨奇一家入住。同时为了保证杨奇一家的安全，燕飞还将一队安保人员调了过来，专门保护杨奇一家的安全。
杨奇的那个全新的实验室是燕飞最为看重的地方，也是雾隐岛在进行建设的时候优先保障的建筑。所以当其它建筑都还没有完工的时候，这个实验室就已经修建完成并验收合格了。里面采购的实验设备也基本到位，而且燕飞还从魔都科研部门抽调了大量的经验丰富的人员过来，协助杨奇展开科学研究。
刚刚开始的时候，那些经验丰富的科研人员还看不上杨奇，觉得杨奇傻傻的，一点也不可靠。但是在杨奇对他们进行第一次讲课之后，他们就完全傻了。因为杨奇讲的内容他们大部分都听不懂，而能听懂的那部分又解决了他们常年以来的疑惑。所以自然就心悦诚服，协助杨奇来开展研究了。
杨奇在戴上思维仪的时候，不但能够进行科技推演，还能利用辅助智脑进入网络世界中，在网络世界收集各种资料个数据。同时也能进入实验室的主控电脑，对自己手下的科研人员下达科研任务。而这些科研任务大多数都是最为前沿的技术，这些科研人员也从杨奇的思路和指导中，学习到非常多的知识，这使得他们的科技素养来了个突飞猛进。
至于依然留在魔都的那个梦幻实验室，就变得无足轻重起来，那里的精英都被抽调到了雾隐岛，只是剩下一个躯壳，他们的研究也只是一些基础研究，用来糊弄其它人的。燕飞已经将所有的重心放在了雾隐岛上的实验室里。
这个实验室完全以杨奇为核心，其他的所有人员都是辅助人员，他们全部为杨奇服务。在推动科技发展源动力的选择上，燕飞选择了以核心科学家带动科技全面发展的方式，而不是依靠广大科学家共同研究带动科技发展。毕竟杨奇的实力远远超出了其他科学家，只有以他为主体，才能减少矛盾和分歧，并快速获得科技进步。
而杨奇在将自己脑海里混乱无章的科技和灵感转移到科技树上，并将这些科技体系融合完善之后，不但让科技树得到了极大的成长，还让他混乱的大脑也变得清晰起来。从来没有一个时候像现在这样，杨奇的大脑是如此的清晰，知道自己到底应该做什么事情，虽然他还是无法理解人类的感情是如何产生的。
在杨奇的带动下，科技树的平均科技水平已经达到了现实世界十年前的水准。但是在一些重要的领域，科技树的成长已经远超当今世界的先进水平，处于绝对的领先地位。而另外一部分领域，虽然还落后于世界先进水平，但是随着科技推演系统的不断推演，这部分落后的科技领域一定会追上来，并实现反超。
而就在燕飞返回雾隐岛，安心发展科技的时候，华夏特勤组的代表游小舟也找到了燕飞，向燕飞打探杨奇的下落。原来华夏方面也发现了飞萍的悬赏任务，并注意到毁灭者在米国出现救走杨奇，他们知道杨奇已经返回了华夏。但是他们并没有在华夏国内找到杨奇，于是他们就找上门来，直接询问直接责任人燕飞。
毕竟作为华夏情报最全面的组织，他们是知道飞萍是燕飞在暗网网络上的马甲号的，而且那个毁灭者和燕飞也有着千丝万缕的关系。同时他们也知道燕飞和杨奇的关系，加上杨奇的父母忽然到了雾隐岛，所以他们马上推断出杨奇应该已经到了雾隐岛上。
华夏方面之前并不清楚杨奇的情况，但是在得到米国方面内线的情报后，他们马上重视起杨奇来。经过对各方面情报的分析，他们发现杨奇居然是华夏最为需要的那一种科学家，但是这么重要的科学家居然一直没有得到足够的重视。而且那个愚蠢的帝都科研所已经彻底得罪杨奇，并将杨奇